1926年，一名来自广东省西部的和尚「畅缘和尚」，选择了现今寺址附近的一个岩洞潜修，并将此地命名为罗汉岩（又称罗汉洞）。到了1960年代中，李耀庭居士等佛教徒来到此处，发现此处的环境适合建立佛寺，征得畅缘和尚同意后，便于1971年动工兴建，1974年落成启用。 罗汉寺的主体建筑为大雄宝殿，高三丈六尺（约12米），面积130平方米，在东涌新市镇发展前，一海之隔的屯门也能看见。大雄宝殿供奉释迦、弥陀和药师。罗汉寺也设有观音殿和地藏殿，以及名为海会塔的骨灰龛位。罗汉寺亦保留罗汉岩这个天然岩洞供奉十八罗汉，以及罗汉泉这个天然山泉。