慈航淨院原名為慈航道場，建於1914年，創建者為宏願法師。宏願法師其後將道場交由智林法師主持。當時，道場內之大雄寶殿。韋馱殿及關房（今爲信衆宿舍）已逐一落成，遂廣作佛事，弘法利生。旋得善信胡文虎先生等這慷慨捐助，擴建並志名爲「慈航淨院」。原設於道貌岸然場講堂之幼稚園義學，獲擴充爲慈航學校，教育失學兒童，造成福鄉民。1932年智林法師往生，淨院落之弘法及推動教育事業的宗旨，由其師弟，亦即淨院之現任住持智海法師加以發揚。 慈航淨院中的大雄寶殿、韋馱殿和關房為最早建成部份，位於正門右側。寶殿內設有三個佛像，分別為釋迦牟尼佛、過去佛和未來佛。在三尊佛像前放有一個來自緬甸的玉佛。大殿後面為觀音殿，兩旁設有藏經櫃，有華嚴經、法華經等供閱讀。宏願紀念堂及祖師堂屬後期建成，位於大雄寶殿和正門講堂之間。宏願紀念堂內放有宏願法師及智林法師的像，亦供奉了兩位師祖及虛雲和尚、海仁和尚等蓮位。 慈航淨院佛學班 慈航淨院每週主辦各類佛學講座供善信參加，並設有「慈航淨院佛學班」網站，定期上載各類網上講座錄音及實體講座資訊。